• Structuration et consolidation de résultats d'analyses de RNAseq et Polymorphisme JOBIM 2019
  Thomas Garcia, Ludovic Legrand, Jérôme Gouzy, Sébastien Carrere
  
• Comparaison de réseaux métaboliques de bactéries phytopathogènes JOBIM 2019
  Ludovic COTTRET, Caroline BAROUKH, Stéphane GENIN
  

• Structuration et consolidation de résultats d'analyses de RNAseq et Polymorphisme GENOTOUL 2018
  Thomas Garcia, Ludovic Legrand, Jérôme Gouzy, Sébastien Carrere
  
• Spark-ICS / Exploration de l’application de l’architecture Apache Spark à la bioinformatique JOBIM 2018
  Axel Verdier, Ludovic Legrand, Xavier Garnier, Erika Sallet, Alexandre Dehne-Garcia, Nicolas Lapalu, Martial Briand, Franck Dorkeld, Bernhard Gschloessl, Corinne Rancurel, Martine Da Rocha, Sébastien Carrère, Céline Noirot, Olivier Filangi, Jérôme Gouzy
  

• SUNSET / Sites UNder SElecTion: When and where does natural selection occur ? GENOTOUL 2016
  Maude Maréchaux, Jean-Jacques Bono, Clare Gough, Benoit Lefebvre, Ludovic Cottret
  

• MetExplore Annotation JOBIM 2015
  Floreal Cabanettes, Benjamin Merlet, Florence Vinson, Clement Frainay, Maxime Chazalvien, Yoann Gloaguen, Sanu Shameer, Nathalie Poupin, Fabien Jourdan, Celine Lavire, Ludovic Cottret
  
• Orthomcl-Companion: Outil web d'aide a l'interpretation d'analyses de familles proteiques JOBIM 2015
  Martial Briand, Corinne Rancurel, Ludovic Cottret, Sebastien Carrere
• EuGene-PP: A next-generation automated annotation pipeline for prokaryotic genomes ECCB 2015
  Erika Sallet, Jérôme Gouzy, Thomas Schiex

2013

JOBIM 2013 https://colloque.inra.fr/jobim2013

• BIOS Architecture Orientee Service. Application a l analyse de donnees RNA-Seq http://bios.toulouse.inra.fr
  Sebastien CARRERE, Emmanuel COURCELLE, Marion VERDENAUD , Eric BIOT, Erika SALLET, Emeline DELEURY, Loick LEDANTEC, Cecile FIZAMES, Jean-Pierre GAUTHIER, Vincent SAVOIS, Susete ALVES-CARVALHO, Philippe GREVET, Veronique BRUNAUD, Fabrice LEGEAI, Bernhard GSCHLOESSL, Virginie GARCIA and Jerome GOUZY.
  
• FlexFlux A flexible Java framework to perform flux balance analyses with regulatory constraints
  Lucas MARMIESSE, Ludovic COTTRET
• Archive Structurer et preserver donnees et metadonnees
  Ludovic LEGRAND, Ludovic COTTRET, Emmanuel COURCELLE, Erika SALLET, Sebastien CARRERE et Jerome GOUZY
• EuGene-PP Automatic and comprehensive annotation Pipeline of Prokaryotic genome with oriented RNAseq
  Erika SALLET, Emmanuel COURCELLE, Thomas FARAUT, Jerome GOUZY and Thomas SCHIEX

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2009

JOBIM 2009 http://www.jobim2009.fr

• Legoo Une plateforme bioinformatique pour la biologie intégrative des legumineuses.
  Marion Verdenaud, Sébastien Carrere, Sébastien Letort, Emeline Deleury, Erika Sallet, Emmanuel Courcelle, Olivier Stahl, Thomas Faraut, Vincent Savois, Karine Gallardo, Frédéric Debelle, Pascal Gamas, Jérome Gouzy
  
• Narcisse Une représentation en mirroir des synténies conservées
  Sébastien Letort, Emmanuel Courcelle, Olivier Stahl, Jérome Gouzy, Thomas Faraut
• Heliagene Le portail bioinformatique du genreHelianthus
  Thibaut Hourlier, David Rengel, Nicolas Langlade, Patrick Vincourt, Jérome Gouzy, Sébastien Carrere
• smallA A toolbox for managing libraries of smallRNA sequences
  Erika Sallet, Christine Lelandais, Martin Crespi, Jérome Gouzy

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2006

• Remora: un poisson pilote dans l'océan des web-services BioMOBY (Journée IFR40)
  
Sébastien Carrere, Jérome Gouzy
• LeARN a platform for detecting, clustering and annotating non-coding RNAs (JOBIM 2006)
  Celine Noirot, Christine Gaspin, Thomas Schiex, Jérome Gouzy
• Présentation Service Informatique et Bioinformatique du LIPM
  Jérome Gouzy

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2005

Paraloop une interface d'acces générique aux ressources de calcul (JOBIM 2005)
Emmanuel Courcelle,Jérome Gouzy

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2004

Narcisse: a mirror view of conserved syntenies
Thomas Faraut, Jérome Gouzy, Yoann Beausse

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