Exercice 4: Analyse des résultats - SNP

Récupération des chromatogrammes

  • cliquez sur le lien bioinfo_form_snp.traces.tar.gz
  • extraction des chromatogrames a partir du fichier comprimé 
    gzip -cd ../bioinfo_form_snp.traces.tar.gz | tar xvf -
  • lancer l'assemblage avec le programme phredPhrap
  • relancer la lecture des chromatogrammes ave le programme phred 
    phred -id ../chromat_dir -dd ../polydir
  • lancer le programme polyphred 
    polyphred -ace SNP.fasta.screen.ace.1

    identifiez un SNP en utilisant le logiciel consed 

    consed&